זהו סלילי הפקודה שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
coils-wrap - מפעיל ncoils שלוש פעמים כדי לתת לך פלט של שלושה חלונות
תַקצִיר
סלילים לעטוף [אופציה]
תיאור
coils-wrap מריץ ncoils שלוש פעמים כדי לתת לך פלט של שלושה חלונות.
ncoils היא תוכנית המשווה רצף למסד נתונים של דו-גדילים מקבילים ידועים
מפותל-סלילים ומסיק ציון דמיון. על ידי השוואת ציון זה להתפלגות
של ציונים בחלבונים כדוריים וחלבונים מפותלים, התוכנית מחשבת את
סבירות שהרצף יאמץ קונפורמציה של סליל מפותל.
אפשרויות
-i קובץ קלט בפורמט FASTA
-o קובץ פלט
-r קובץ פלט גולמי, ברירת מחדל: ` _גלם'
-m סוג מטריצה; הגדר מטריצה (MTK או MTIDK)
-w משקל a&d = b,c,e,f&g (בוליאנית)
דוגמאות
"coils-wrap -m MTIDK -i /usr/share/doc/ncoils/1srya.fa -o /tmp/coils.out -r
/tmp/coils_raw.txt && פחות /tmp/coils.out /tmp/coils_raw.txt"
"ncoils -win 14 < /usr/share/doc/ncoils/1srya.fa"
השתמש ב-coils-wrap מקוון באמצעות שירותי onworks.net
