זוהי אפליקציית לינוקס בשם Auto Primer3 שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם AutoPrimer3-3.0.2_installer.exe. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Auto Primer3 עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
פריימר אוטומטי 3
תיאור
שימו לב: עמוד הפרויקט הזה לא יעודכן יותר - אנא השתמשו בעמוד GITHUB (https://github.com/gantzgraf/autoprimer3) כדי למצוא את הגרסה האחרונה (https://github.com/gantzgraf/autoprimer3/releases/latest).
AutoPrimer3 מאחזר מידע גנים, רצפי DNA ומידע SNP מדפדפן הגנום של UCSC ומשתמש ב-primer3 לעיצוב אוטומטי של פריימרים לגנים או למטרות קואורדינטות גנומיות.
ניתן לעצב פריימרים באמצעות מידע מכל אחד מהגנומים המתארחים ב-UCSC וניתן ליצור פריימרים כדי למנוע SNPs חופפים עבור גנומים שבהם מסדי נתונים של SNP זמינים.
תכונות
- עיצוב אוטומטי של פריימרים לגנים, תעתיקים או קואורדינטות גנומיות
- העלה קבצי BED או VCF ועצב פריימרים לקואורדיאנטים שצוינו
- ייצא פלט פריימר לקבצי .txt, .csv או .xlsx
- הימנעו אוטומטית מעיצוב פריימרים על גבי SNPs ידועים
- בדוק אוטומטית תוצאות PCR בסיליקו עבור זוגות מעוצבים
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
JavaFX
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/autoprimer3/. הוא התארח ב-OnWorks כדי להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
