これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド asnXNUMXidx です。
プログラム:
NAME
asn2idx - 個々の配列に高速にアクセスするための ASN.1 Bioseq セットのインデックス
SYNOPSIS
asn2idx [-] [-b] [-d DIR] [-f filter ] -p path [-r path] [-t] [-x STR]
DESCRIPTION
asn2idx ASN.1 Bioseq セット (GenBank リリース ファイルなど) のインデックスを作成して、検索を高速化します。
それらに含まれる個々のシーケンス。 処理するファイルごとに、
同じディレクトリに拡張子が付いた出力ファイル .idx.
OPTIONS
オプションの概要は以下に含まれています。
- 使用状況メッセージを印刷する
-b Bioseq セットはバイナリです
-d DIR 必要なサブディレクトリ
-f filter
フィルター (デフォルト = gbcon、gbest、gbgss、gbhtg、gbsts)
-p path
ファイルへのパス
-p path
結果へのパス
-t 再帰
-x STR ファイル選択部分文字列 (デフォルト = 。そう)
onworks.net サービスを使用してオンラインで asn2idx を使用する