ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gt-eval ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gt-eval - ປຽບທຽບໄຟລ໌ annotation ແລະສະແດງມາດຕະການຄວາມຖືກຕ້ອງ (ການຄາດຄະເນທຽບກັບເອກະສານອ້າງອີງ).
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gt ການປະເມີນ reference_file ການຄາດເດົາ_file
ລາຍລະອຽດ
- ນູກ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ການປະເມີນລະດັບ nucleotide (ການບໍລິໂພກຫນ່ວຍຄວາມຈໍາແມ່ນອັດຕາສ່ວນກັບຂະຫນາດໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ)
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ແມ່ນແລ້ວ)
-ltr [ແມ່ນ|ບໍ່]
ປະເມີນການຄາດຄະເນ LTR retrotransposon ແທນທີ່ຈະເປັນການຄາດຄະເນ gene (ທັງຫມົດ
ອົງປະກອບ LTR_retrotransposon ຖືກພິຈາລະນາວ່າມີສາຍທີ່ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ) (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ:
ບໍ່)
-ltdelta [ມູນຄ່າ]
ຕັ້ງຄ່າ delta ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ສໍາລັບ LTR ຊາຍແດນທີ່ຖືວ່າເທົ່າທຽມກັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 20)
-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-o [ຊື່ເອກະສານ]
ປ່ຽນເສັ້ນທາງຜົນຜະລິດໄປຫາໄຟລ໌ທີ່ລະບຸ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
-gzip [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນ gzip ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-bzip2 [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ bzip2 (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
- ຜົນບັງຄັບໃຊ້ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ບັງຄັບໃຫ້ຂຽນເປັນໄຟລ໌ອອກ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ
-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ
ໂປຣແກຣມສະແດງຄ່າຄວາມອ່ອນໄຫວ ແລະສະເພາະສຳລັບບາງປະເພດຄຸນສົມບັດ (ຕົວຢ່າງ:
gene, mRNA, ແລະ exon). ສໍາລັບບາງປະເພດຄຸນນະສົມບັດຈໍານວນຂອງການຂາດຫາຍໄປແລະລັກສະນະຜິດພາດຂອງ
ປະເພດນັ້ນຍັງສະແດງໃຫ້ເຫັນ. ດ້ວຍເຫດນີ້, "ຂາດ" ຫມາຍເຖິງຈໍານວນຂອງລັກສະນະປະເພດນັ້ນຈາກ
"ການອ້າງອິງ" ໂດຍບໍ່ມີການທັບຊ້ອນກັບລັກສະນະຂອງປະເພດນັ້ນຈາກ "ການຄາດເດົາ". ຮອງ
ກົງກັນຂ້າມ, "ຜິດ" ຫມາຍເຖິງຈໍານວນຂອງລັກສະນະປະເພດນັ້ນຈາກ "ການຄາດເດົາ" ໂດຍບໍ່ມີ
ທັບຊ້ອນກັນກັບລັກສະນະຂອງປະເພດນັ້ນຈາກ "ການອ້າງອີງ".
ການລາຍງານ ບັກ
ລາຍງານບັກຫາgt-users@genometools.org>.
ໃຊ້ gt-eval ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net