ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ QUAST ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ quast-5.0.2.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ QUAST ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
QUAST
ລາຍລະອຽດ
QUAST ປະຕິບັດການປະເມີນຜົນຄຸນນະພາບໄວແລະສະດວກແລະການປຽບທຽບການປະກອບ genome.
QUAST ຄິດໄລ່ຈໍານວນຕົວຊີ້ວັດທີ່ມີຊື່ສຽງ, ລວມທັງຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງ contig, ຈໍານວນຂອງ genes ທີ່ຄົ້ນພົບ, N50, ແລະອື່ນໆ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການແນະນໍາໃຫມ່ເຊັ່ນ NA50 (ເບິ່ງລາຍລະອຽດໃນເອກະສານແລະໃນຄູ່ມື). ການວິເຄາະທີ່ສົມບູນແບບເຮັດໃຫ້ຕາຕະລາງສະຫຼຸບ (ໃນຂໍ້ຄວາມທໍາມະດາ, ຮູບແບບທີ່ແຍກອອກຈາກແຖບແລະ LaTeX) ແລະຮູບແບບສີສັນ. ເຄື່ອງມືດັ່ງກ່າວຍັງຜະລິດບົດລາຍງານເວັບໄຊຕ໌ທີ່ condensing ຂໍ້ມູນທັງຫມົດໃນຫນຶ່ງໄຟລ໌ທີ່ງ່າຍທີ່ຈະນໍາທາງ.
QUAST ມີອິນເຕີເຟດແຖວຄໍາສັ່ງທີ່ເຂົ້າໃຈງ່າຍ ແລະຄູ່ມືລາຍລະອຽດເພື່ອຊ່ວຍໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ແລ່ນມັນ ແລະເຂົ້າໃຈຜົນຜະລິດຂອງມັນ. ນອກຈາກນັ້ນ, ຫ້ອງທົດລອງເລີ່ມມີເວີຊັ່ນເບຕ້າຂອງ web-QUAST ຢູ່ http://quast.bioinf.spbau.ru/ ເຊິ່ງເຮັດໃຫ້ການປະເມີນຄຸນນະພາບແມ່ນງ່າຍດາຍຫຼາຍ.
ເອກະສານ QUAST ແລະ MetaQUAST (ສ່ວນຂະຫຍາຍສໍາລັບການປະກອບ metagenomic) ໄດ້ຖືກຈັດພີມມາໃນ Bioinformatics.
ຄຸນລັກສະນະ
- ບົດລາຍງານເວັບໄຊຕ໌, ຕາຕະລາງໃນຮູບແບບ txt ທໍາມະດາ, ແຖບແຍກແລະຮູບແບບ LaTeX
- ດິນຕອນທີ່ມີສີສັນ ແລະ histograms
- ການປະເມີນຜົນຄຸນນະພາບທີ່ມີແລະບໍ່ມີ genome ອ້າງອີງ
- ການປະເມີນຜົນຄຸນນະພາບຂອງອຸປະກອນ metagenomic
- ຕົວທ່ອງເວັບຂອງ contig ແບບໂຕ້ຕອບ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ນັກພັດທະນາ, ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍ/ເດັສທັອບ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ອີງໃສ່ເວັບ, ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python, JavaScript
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/quast/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
