ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ trj_cavity ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ trj_cavity_v2.1.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ trj_cavity ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
trj_cavity ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
trj_cavity ຊອກຫາຢູ່ຕາມໂກນທາດໂປຼຕີນໃນທົ່ວເສັ້ນທາງການຈໍາລອງ Molecular Dynamics (MD). ໂຄງການນີ້ເຮັດວຽກຮ່ວມກັບໄຟລ໌ໃນຮູບແບບ PDB, ແຕ່ວ່າມັນຍັງສາມາດອ່ານ / ສ້າງຮູບແບບທີ່ເຫມາະສົມ GROMACS ເຊັ່ນ XTC.ໂຄງການດຽວກັນສາມາດຖືກລວບລວມເປັນເຄື່ອງມື GROMACS ຫຼືເປັນສະບັບ standalone. ຄໍາແນະນໍາການຕິດຕັ້ງແມ່ນສະຫນອງໃຫ້ຢູ່ໃນໄຟລ໌ INSTALL ຂອງໂຄງການແລະໃນ https://sourceforge.net/p/trjcavity/wiki/Home/#ffad
ຖ້າທ່ານຕ້ອງການສະຫນັບສະຫນູນການນໍາໃຊ້ເຄື່ອງມືນີ້ (ຫຼືລາຍງານຂໍ້ບົກພ່ອງ), ກະລຸນາປະກາດມັນຢູ່ໃນເວທີສົນທະນາ.
ຂໍ້ສັງເກດ: v2 ແລ່ນຂະໜານກັນ ແລະຮອງຮັບຊຸດ GROMACS v5.1+. ຖ້າທ່ານຕ້ອງການສືບຕໍ່ນຳໃຊ້ GROMACS v4.x, ກະລຸນາໃຊ້ trj_cavity_v1.1.
ຄຸນລັກສະນະ
- ຊອກຫາຢູ່ຕາມໂກນທາດໂປຼຕີນໃນເສັ້ນທາງການຈໍາລອງ MD.
- ຜະລິດເສັ້ນທາງ MD ຂອງທາດໂປຼຕີນຈາກຢູ່ຕາມໂກນທຽບກັບເວລາ.
- ສະຫນອງສະຖິຕິການແຜ່ກະຈາຍທາດໂປຼຕີນ.
- ຄຳນວນຕົວອະທິບາຍປະລິມານຊ່ອງຄອດ.
- ໂປຣໄຟລ radius tunnel ແກນປົກກະຕິ.
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C ++
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/trjcavity/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
