BarraCUDA Fast Short Read Aligner എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് barracuda_0.7.107h.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
BarraCUDA Fast Short Read Aligner with OnWorks എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് സൗജന്യമായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
BarraCUDA ഫാസ്റ്റ് ഷോർട്ട് റീഡ് അലൈനർ
വിവരണം
സാംഗറിന്റെ BWA അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഒരു ഹൈ-സ്പീഡ് സീക്വൻസ് അലൈനറാണ് ബാരാക്കുഡ, അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസറുകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്ന സീക്വൻസ് റീഡുകളുടെ അലൈൻമെന്റുകൾ ത്വരിതപ്പെടുത്തുന്നതിന് ഏറ്റവും പുതിയ എൻവിഡിയ CUDA ആർക്കിടെക്ചർ ഉപയോഗിക്കുന്നു.
സവിശേഷതകൾ
- ഉബുണ്ടു 16.04-ൽ സോഫ്റ്റ്വെയർ കംപൈൽ ചെയ്യുന്നതിലെ പ്രശ്‌നങ്ങൾ പരിഹരിച്ചു
- ട്വീക്ക്: SAMPE 8-കോർ പരിധി ഇപ്പോൾ എടുത്തുകളഞ്ഞു
- NVIDIA CUDA ആക്സിലറേഷൻ ഉപയോഗിച്ച് FM-ഇൻഡക്സ് സീക്വൻസിങ് റീഡ് മാപ്പർ സോഫ്റ്റ്വെയർ
- ഡൗൺസ്‌ട്രീം വിശകലനങ്ങൾക്കായി SAM ഫോർമാറ്റിലുള്ള ഔട്ട്‌പുട്ടുകൾ
- 3.5 അല്ലെങ്കിൽ അതിനു മുകളിലുള്ള കമ്പ്യൂട്ട് ശേഷിയും കുറഞ്ഞത് 1GB VRAM ഉം ഉള്ള NVIDIA ഗ്രാഫിക്സ് കാർഡ് ആവശ്യമാണ്
- NVIDIA CUDA SDK ടൂൾകിറ്റ് 6.x അല്ലെങ്കിൽ അതിന് മുകളിലുള്ളതും NVIDIA ഡ്രൈവർ 340 അല്ലെങ്കിൽ അതിന് മുകളിലും ആവശ്യമാണ്
- BMC റിസർച്ച് നോട്ടുകൾ 2012, 5:27, doi:10.1186/1756-0500-5-27-ൽ BarraCUDA പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു.
- പേപ്പർ URL: http://www.biomedcentral.com/1756-0500/5/27
- ഈ പ്രോജക്ടിനെ കേംബ്രിഡ്ജ് യൂണിവേഴ്സിറ്റിയിലെ CUDA സെന്റർ ഓഫ് എക്സലൻസ് പിന്തുണയ്ക്കുന്നു
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
സി++, സി
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/seqbarracuda/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
