Dit is de opdrachtafetch die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online-emulator of MAC OS online-emulator
PROGRAMMA:
NAAM
afetch - haal een uitlijning op uit een uitlijningsdatabase
KORTE INHOUD
halen [Opties] uitlijndb sleutel
halen --inhoudsopgave uitlijndb
PRODUCTBESCHRIJVING
halen haalt de genoemde uitlijning op sleutel uit een uitlijningsdatabase in bestand uitlijndb.
uitlijndb is een "multiple multiple alignment"-bestand in Stockholm (bijv. native Pfam)
formaat.
sleutel is de naam (ID) van de uitlijning of het toegangsnummer (AC).
De uitlijndb bestand moet eerst SSI worden geïndexeerd met halen --inhoudsopgave voor efficiënt
ophalen. Een SSI-index is niet vereist, maar het ophalen van uitlijning zonder een index kan dat wel zijn
tergend langzaam.
OPTIES
-h Korte hulp afdrukken; inclusief versienummer en overzicht van alle opties, inclusief
deskundige opties.
EXPERT OPTIES
--inhoudsopgave
In plaats van het ophalen van een key, het speciale commando halen --inhoudsopgave uitlijndb
produceert een SSI-index van de namen en toevoegingen van de uitlijningen in het bestand
uitlijndb. Dit moet een keer worden uitgevoerd op de uitlijndb bestand om het voor iedereen voor te bereiden
toekomstige afetch's.
Gebruik afetch online met behulp van onworks.net-services
