Dit is de opdracht last-pair-probs die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
last-pair-probs - Lees de uitlijningen van gepaarde DNA-uitlezingen met een genoom en voer schattingen uit
KORTE INHOUD
laatste-paar-probs [opties] interleaved-uitlijningen
laatste-paar-probs [opties] uitlijningen1 uitlijningen2
PRODUCTBESCHRIJVING
Lees de uitlijningen van gepaarde DNA-aflezingen met een genoom, en: (1) schat de verdeling van
afstanden tussen gepaarde lezingen, (2) schat de waarschijnlijkheid dat elke uitlijning
vertegenwoordigt de genomische bron van de lezing.
OPTIES
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
-r, --na
neem aan dat de metingen afkomstig zijn van potentieel gesplitst RNA
-e, --estdist
schat gewoon de verdeling van afstanden
-m M, --verkeerde kaart=M
schrijf geen uitlijningen met een mismap-kans > M (standaard: 0.01)
-f BP, --fraglen=BP
gemiddelde afstand in bp
-s BP, --sdev=BP
standaardafwijking van afstand
-d KANS, -- onsamenhangend=KANS
voorafgaande waarschijnlijkheid van disjuncte mapping (standaard: 0.02 if -r, anders 0.01)
-c CHROOM, --circulaire=CHROOM
specificeert dat chromosoom CHROM circulair is (standaard: chrM)
-V, --versie
toon het versienummer van het programma en sluit af
Gebruik last-pair-probs online met behulp van onworks.net-services
