Dit is de opdrachtuitbreiding die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
brancard - Needleman-Wunsch snelle globale uitlijning van twee sequenties
KORTE INHOUD
brancard -een sequentie volgorde -volgorde volgorde [-data bestand Matrix] [-gapen geheel getal]
[-gapeextend geheel getal] -uitbestand richten
brancard -Help
PRODUCTBESCHRIJVING
brancard is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Softwaresuite"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep(en) "Alignment:Global".
OPTIES
Invoer sectie
-een sequentie volgorde
-volgorde volgorde
-data bestand Matrix
Dit is het scorematrixbestand dat wordt gebruikt bij het vergelijken van reeksen. Standaard is het de
bestand 'EBLOSUM62' (voor eiwitten) of het bestand 'EDNAFULL' (voor nucleïnezuursequenties). Deze
bestanden zijn te vinden in de 'data' directory van de EMBOSS installatie.
Extra sectie
-gapen geheel getal
Standaardwaarde: @($(acdproteïne)? 12: 16)
-gapeextend geheel getal
Standaardwaarde: @($(acdproteïne)? 2: 4)
uitgang sectie
-uitbestand richten
Gebruik stretchere online met behulp van onworks.net-services