Dit is de Linux-app met de naam NGSReadsTreatment waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als NgsReadsTreatmentGI_v1.2.jar. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd NGSReadsTreatment met OnWorks gratis online uit.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
NGSReads-behandeling
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
NGSReadsTreatment, een computationele tool voor het verwijderen van gedupliceerde reads in paired-end of single-end datasets. NGSReadsTreatment kan reads verwerken vanaf elk platform met dezelfde of verschillende reekslengtes. Met behulp van de probabilistische structuur Cuckoo Filter worden de redundante uitlezingen geïdentificeerd en verwijderd door de uitlezingen met zichzelf te vergelijken. Er is dus geen vereiste vereist buiten de set leesbewerkingen. NGSReadsTreatment werd vergeleken met andere hulpprogramma's voor het verwijderen van redundantie bij het analyseren van verschillende leessets. De resultaten toonden aan dat NGSReadsTreatment beter was dan de andere tools, zowel wat betreft het aantal verwijderde redundanties als het gebruik van rekengeheugen voor alle uitgevoerde analyses.Opmerking: gebruik Java versie 11 om de nieuwe versie uit te voeren.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/ngsreadstreatment/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.