Dit is de Linux-app genaamd raxmlGUI waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als raxmlGUI1.5b3.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam raxmlGUI gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
raxmlGUI
PRODUCTBESCHRIJVING
RELEASE OPMERKING: Download raxmlGUI 2.0 op de NIEUWE PROJECTLOCATIE: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/raxmlGUI is een grafische gebruikersinterface voor RAxML, een van de meest populaire en meest gebruikte software voor fylogenetische inferentie met maximale waarschijnlijkheid.
Een gebruiksvriendelijke grafische front-end voor fylogenetische analyses met behulp van RAxML (Stamatakis, 2006). Citeer alstublieft: Silvestro, Michalak (2012) - raxmlGUI: een grafische front-end voor RAxML. Organismen diversiteit en evolutie 12, 335-337. DOI: 10.1007/s13127-011-0056-0
Kenmerken
- *NIEUWE VERSIE 2.0 NU BESCHIKBAAR: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/*
- *versie 1.5* voegt de mogelijkheid toe om analyses uit te voeren via CIPRES Science Gateway
- De GUI bevat RAxML-uitvoerbare bestanden
- Compatibiliteit met meerdere platforms (Mac OS, Windows, Linux)
- Vereist Python 2.6, 2.7
- Intuïtieve interface voor gegevenspartitionering en outgroup-selectie
- Modelselectie voor DNA-, aminozuur-, binaire en multistate-uitlijningen
- Automatische conversie NEXUS naar PHYLIP (en vice versa)
- Importeer FASTA-bestanden
- Wederopbouw van de voorouderlijke staat
- "Bootstop"-functie (Pattengale et al. 2010)
- Interactieve uitsluiting van sites
- Meerdere uitlijningen combineren met automatische partitionering
- Interactieve definitie van topologische beperkingen
- Robinson-Foulds paarsgewijze afstanden
- Waarschijnlijkheden per site
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Tk
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/raxmlgui/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.