Dit is de Linux-app met de naam AMBIENT om online in Linux te draaien waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als ambient-1.3.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download deze app met de naam AMBIENT en voer deze online uit om gratis in Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
AMBIENT om online in Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
BELANGRIJK: Sinds de publicatie van de AMBIENT-methode in BMC Sys Bio zijn er verschillende updates gemaakt. Als u de versie wilt gebruiken die in het document wordt gebruikt, is dit v0.6.3, maar ik raad u aan de nieuwste versie te gebruiken die op dezelfde manier werkt, maar met extra opties en met stabiliteits- en prestatieverbeteringen. Bedankt voor uw interesse!AMBIENT (Active Modules for Bipartite Networks) is een Python-module die gesimuleerde uitgloeiing gebruikt om gebieden van een metabolisch netwerk (modules) te vinden die een consistent kenmerk hebben. AMBIENT vereist geen vooraf gedefinieerde paden en geeft zeer specifieke voorspellingen van de getroffen stofwisselingsgebieden.
Scores voor reacties op basis van transcriptiegegevens van hun geannoteerde coderende genen kunnen bijvoorbeeld in het netwerk worden gebruikt en er kunnen modules van gecoördineerde expressieveranderingen worden gevonden. Dit biedt een alternatief voor verrijkingsanalyses van routes/genen, dat tegelijkertijd flexibeler en specifieker is.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/ambient-bio/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
