Dit is de Linux-app met de naam CAMPARI die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als campari_v3_09052017.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam CAMPARI online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
CAMPARI om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Met trots introduceren wij versie 3 van CAMPARI. Dit is een grote stap ten opzichte van versie 2, voornamelijk vanwege de uitgebreide ondersteuning voor OpenMP (threads parallellisme) en vanwege aanzienlijke verbeteringen in zowel bruikbaarheid als prestaties. We hebben ook opnieuw een aantal nieuwe algoritmen uit de recente literatuur toegevoegd, en CAMPARI blijft uiteraard het ABSINTH-krachtveldparadigma en het impliciete oplossingsmodel ondersteunen.CAMPARI is een gezamenlijk pakket voor het uitvoeren en analyseren van moleculaire simulaties, in het bijzonder van polymeren van biologisch belang. Het richt zich op een brede beschikbaarheid van algoritmen voor (geavanceerde) bemonstering en is in staat Monte Carlo- en moleculaire dynamische bemonstering naadloos te combineren. CAMPARI biedt de gebruiker een zeer hoog niveau van controle over alle geïmplementeerde functies. Voor meer informatie en functies kunt u terecht op de homepage van het project op http://campari.sourceforge.net. Versie 2 wordt niet langer actief onderhouden, maar de definitieve versie blijft beschikbaar.
Kenmerken
- Gecombineerde MC- en MD-sampling, MD in cartesiaanse of torsie-/starre lichaamsruimte
- Efficiënte OpenMP-parallellisatie van alle kernenergie-/krachtroutines
- On-the-fly analyse of uitvoering als trajectanalysetool (ook parallel)
- Veel ingebouwde analyseroutines (DSSP, contactkaarten, paarcorrelatiefuncties, enz.)
- Ondersteuning voor verschillende structurele clustering en gerelateerde algoritmen, samen met Markov-staatsmodelanalyses
- Volledig gedocumenteerd (html) en bovendien geleverd met 13 tutorials
- Zeer hoog niveau van controle (bijv. aangepaste holonomische beperkingen in MD)
- Brede ondersteuning voor parallelle multi-replicasimulatietechnieken zoals replica-uitwisseling in hybride MPI/OpenMP parallelle uitvoering
- Stand-alone analysefaciliteit voor de clustering/Markov-staatsmodelfaciliteiten
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Fortran
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/campari/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
