Dit is de Linux-app met de naam Hamstr waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik gratis deze app genaamd Hamstr met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
hamstr
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
HaMStR is verhuisd naar https://github.com/bionf/hamstr waar het nu deel uitmaakt van het HaMStR-OneSeq-pakket.
HaMStR is een op een Markov-model gebaseerd hulpmiddel met verborgen profielen voor een gerichte orthologe zoekopdracht in EST- of eiwitsequentiegegevens. Het programma neemt een vooraf gedefinieerde kerngroep van orthologe sequenties (core orthologen) en een set sequenties uit een zoektaxon als invoer. HaMStR combineert vervolgens in een tweestapsstrategie een op pHMM gebaseerde zoekactie en een omgekeerde zoekactie via BLAST om de kernorthologgroep uit te breiden met nieuwe sequenties van het zoektaxon.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
