Dit is de Linux-app genaamd MuffinEC waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als muffinec-2.0b.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam MuffinEC gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
Muffin EC
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
MuffinEC is software voor foutcorrectie die alle soorten fouten kan verwerken (verwijderingen van invoegingen, mismatches en onbekende basen). Het ondersteunt officieel vier technologieën (Illumina, 454, ion Torrent en PacBio - experimenteel) en het heeft ook een generieke opzet voor andere (oud en/of nieuw). Het is uitgebracht onder LGPL versie 3.0. MuffinEC kan multicore-systemen gebruiken dankzij de OpenMP-implementatie.
We ontwikkelen de 2e versie van MuffinEC. De bètaversie is al online beschikbaar. De wijzigingen worden vermeld in het VERSION_HISTORY-bestand. Meld elk probleem dat u tegenkomt op het e-mailadres dat is opgegeven in het README-bestand. We stellen uw hulp zeer op prijs.
Kenmerken
- Behandelt invoegingen, verwijderingen, mismatches, onbekende basen
- Ondersteunt Illumina, 454, Ion Torrent en PacBio (experimenteel)
- Generieke parameter voor andere technologieën
- Meerdradig
- Laag geheugenverbruik
Toehoorders
Informatietechnologie, gezondheidszorg, wetenschap/onderzoek, geavanceerde eindgebruikers, ontwikkelaars, eindgebruikers/desktop
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
C + +
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/muffinec/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
