Dit is de Linux-app met de naam parastructure om online in Linux te draaien waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als parastructure.0.9.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam parastructure online uit om gratis in Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
parastructuur om online in Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
parastructure is een perl-scriptverzameling om de populatiegenetica-software STRUCTURE van Pritchard et al. uit te voeren. 2000 (http://pritch.bsd.uchicago.edu/structure.html) parallel op een cluster (beowulf-type). Elke run van K (het aantal populaties) wordt afzonderlijk uitgevoerd op elke CPU van het cluster via wachtrijsysteem op basis van PBS.Een samenvattende statistische tabel en cijfers (Noah Rosenberg: http://www.stanford.edu/group/rosenberglab/distruct.html) worden gebouwd aan het einde van de run.
Een patch voor de structuur (ran.c) is ook aanwezig om het genereren van het seed-nummer te corrigeren.
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Unix-shell, Perl, C
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/parastructure/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
