Dit is de Linux-app genaamd SW# waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als swsharp-src.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app met de naam SW# gratis online met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SW #
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
SW# (swsharp) is een bibliotheek voor sequentie-uitlijning op basis van CUDA-enabled GPU's. Het maakt gebruik van het Hirschbergs- en Ukkonens-algoritme voor geheugenefficiëntie en extra snelheid. De bibliotheek is schaalbaar voor gebruik met meerdere GPU's. Sommige delen van de bibliotheek gebruiken MPI voor CUDA-enabled clusters.Dit werk is gedeeltelijk ondersteund door de Kroatische Science Foundation in het kader van het project UIP-11-2013-7353.
Database zoeken nu beschikbaar!
publicaties:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
Gerelateerd werk:
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
NIEUW:
SW# webeditie:
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/swsharp/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
