Dit is de Windows-app genaamd Calis-p die in Windows online via Linux online kan worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als calis-p-0.1.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online deze app genaamd Calis-p uit om gratis in Windows online via Linux online te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
Calis-p draait in Windows online via Linux online
PRODUCTBESCHRIJVING
Calis-p (de CALgary-benadering van ISotopes in proteomics) is een softwarepakket om rechtstreeks stabiele koolstofisotopenvingerafdrukken (SIF's) van individuele soorten in een microbiële gemeenschap uit een metaproteomische dataset te extraheren. Het neemt de gescoorde peptide-spectrum match (PSM) tabellen voor monsters en het kalibratiemateriaal, en de onbewerkte MS-gegevens in mzML-formaat als invoer. In de eerste stap vindt de software de isotopenpieken voor elke PSM en somt hun intensiteiten op over een gespecificeerd retentietijdvenster. De geïdentificeerde isotopenpatronen (paren van m/z-waarde + gesommeerde intensiteiten) samen met de somformule van de geïdentificeerde peptiden worden gerapporteerd en gebruikt als invoer voor de tweede stap van Calis-p om delta13C-waarden te berekenen voor alle peptiden die een set passeren van filters, evenals gemiddelde delta13C-waarden en standaardfouten voor elke soort. De soort delta13C-waarden moeten worden gecorrigeerd voor fractionering van instrumentisotopen door de offset toe te passen die is bepaald met behulp van het referentiemateriaal.Kenmerken
- SIF-gegevens worden rechtstreeks geëxtraheerd uit een standaard metaproteomische dataset
- Verkrijg op efficiënte en betrouwbare wijze SIF-waarden voor een groot aantal soorten in een monster van een microbiële gemeenschap op een manier met hoge doorvoer.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
