Dit is de Windows-app genaamd CAMPARI waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als campari_v4_12202020.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd CAMPARI gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
CAMPARI
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Met trots introduceren wij versie 4 van CAMPARI. Met behoud van de filosofie geïntroduceerd met V3 om (bijna) alles te versnellen met behulp van OpenMP (threads parallellisme), hebben we een aantal nieuwe algoritmen uit de recente literatuur toegevoegd, met name een hele module die zich bezighoudt met kleine moleculen van willekeurige chemie voor toepassingen in computationeel docking en medicijnontwerp. Uiteraard blijft CAMPARI de referentie-implementatie bieden van het ABSINTH-krachtveldparadigma en het impliciete oplossingsmodel.
CAMPARI is een gezamenlijk pakket voor het uitvoeren en analyseren van moleculaire simulaties, in het bijzonder van systemen van biologisch belang. Het richt zich op een brede beschikbaarheid van algoritmen voor (geavanceerde) bemonstering en is in staat Monte Carlo en moleculaire dynamica naadloos te combineren. CAMPARI biedt de gebruiker een zeer hoog niveau van controle over alle geïmplementeerde functies. Voor meer informatie en functies kunt u terecht op de homepage van het project op http://campari.sourceforge.net.
Kenmerken
- Gecombineerde MC- en MD-sampling, MD in cartesiaanse of torsie-/starre lichaamsruimte
- Efficiënte OpenMP-parallellisatie van alle kernenergie-/krachtroutines
- On-the-fly analyse of uitvoering als trajectanalysetool (ook parallel)
- Veel ingebouwde analyseroutines (DSSP, contactkaarten, paarcorrelatiefuncties, enz.)
- Ondersteuning voor verschillende structurele clustering en gerelateerde algoritmen, samen met Markov-staatsmodelanalyses
- Stand-alone analysefaciliteit voor de clustering/Markov-staatsmodelfaciliteiten
- Volledig gedocumenteerd (html) en bovendien geleverd met 16 tutorials
- Zeer hoog niveau van controle over bijna alle ondersteunde functies
- Brede ondersteuning voor parallelle multi-replicasimulatietechnieken zoals replica-uitwisseling in hybride MPI/OpenMP parallelle uitvoering
- Ondersteuning voor screeningtoepassingen voor kleine moleculen met gedeeltelijk automatische parametrisering
- Ondersteuning voor vele bias-potentialen (afstanden, posities, torsies, secundaire structuur, ruimtelijke dichtheden, compartimentering, polymere eigenschappen)
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Fortran
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/campari/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
