Dit is de Windows-app genaamd Covidex waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Covidex_2021_11_27.rar. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam Covidex gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
covidex
PRODUCTBESCHRIJVING
Virale subtypen of clades vertegenwoordigen clusters tussen isolaten van de wereldpopulatie van een bepaalde soort. Subtypering is relevant voor studies over virusepidemiologie, evolutie en pathogenese. In die zin is Covidex ontwikkeld als een open source uitlijningsvrije subtyperingstool voor machinaal leren. Het is een glanzende app die een snelle en nauwkeurige classificatie van virale genomen in vooraf gedefinieerde clusters mogelijk maakt. Als er meer dan 1000 sequenties zijn geladen, werkt de tool in multithread-modus. In staat om 16000 genoomsequenties in minder dan een minuut te classificeren (AMD Ryzen 7 1700 8-core Processor 3 GHz)
Ga voor een webgebaseerde versie van de app (alleen voor kleine datasets: max. 100 seqs) naar
http://covidex.unlu.edu.ar
Als u Covidex gebruikt, overweeg dan om de volgende preprint te vermelden:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Als je denkt dat mijn werk nuttig is, kun je een kopje koffie voor me kopen! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Kenmerken
- Subtypering van reeksen
- Gebruiksvriendelijke interface
- Samenvatting plots
- Draagbare versie voor Windows (geen installatie nodig)
- Multithread-modus
Toehoorders
Wetenschap/Onderzoek, Eindgebruikers/Desktop
Programmeertaal
R
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/covidex/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
