Dit is de Windows-app genaamd Genome Microsatellite Analyzing Tool waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als gmatoV1.2Build20130106.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app met de naam Genome Microsatellite Analyzing Tool met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
Genoom Microsatelliet Analyse Tool
BESCHRIJVING:
De toenemende beschikbaarheid van sequenties van steeds meer enorme hele genomen (>1G) versloeg de huidige bestaande SSR-analysetools. Genome-wide Microsatellite Analyzing Tool (GMATo) is een nieuw krachtig programma voor snellere SSR-mining op elke lengte, elke grootte en uitgebreide statistische analyse op genoomaspect, speciaal ontworpen voor enorm genoom op basis van Perl-scripts. Er is slechts één invoerbestand nodig dat DNA-sequenties bevat in onbewerkte fasta-indeling en uitvoerbestanden in tabelvorm die alle SSR-loci-informatie en statistische distributie op vier biologen-geïnteresseerde classificaties bevatten. GMATo heeft ook een eenvoudige en grafische gebruikersinterface die is gescript in Java en een opdrachtregelinterface in Perl, ofwel draaiend in Windows, Linux en Mac enz. platforms met eenvoudig aan te passen parameters voor biologen en bio-informatici. Software GMATo is een beter hulpmiddel voor SSR-karakterisering in een enorm genoomciteer dit artikel: Wang X. et al, Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/gmato/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.