Dit is de Windows-app genaamd PepDistiller waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als PD_1_28_release_20140702.7z. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd PepDistiller gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
PepDistiller
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
In dit onderzoek presenteerden we een kwaliteitscontroletool genaamd PepDistiller om de validatie van MASCOT-zoekresultaten te vergemakkelijken. Door het aantal tryptische termini op te nemen en een verfijnde berekeningsmethode voor het valse ontdekkingspercentage (FDR) te integreren, hebben we de verbeterde gevoeligheid aangetoond van peptide-identificaties verkregen uit semitryptische zoekresultaten. Op basis van de analyse van een complexe dataset werden met PepDistiller ongeveer 7% meer peptide-identificaties verkregen dan met MASCOT Percolator. Bovendien genereerde de verfijnde methode lagere FDR-schattingen dan het percentage incorrecte doel (PIT) vaste methode toegepast in Percolator. Met behulp van een standaard dataset hebben we verder de verhoogde nauwkeurigheid van de verfijnde FDR-schattingen gedemonstreerd ten opzichte van de PIT-vaste FDR-schattingen. PepDistiller is snel en gemakkelijk te gebruiken en is gratis beschikbaar voor academische toegang. De software kan ook worden gedownload van http://www.bprc.ac.cn/pepdistiller.
Kenmerken
- Kwaliteitscontrole
- proteomics
- Peptide-identificatie
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/pepdistiller/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
