Dit is de Windows-app met de naam YeastpRofile die in Windows online via Linux online moet worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als YeastpRofile_V.2.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam YeastpRofile online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCHERMSCHERMEN:
YeastpRofile om online in Windows via Linux online te draaien
BESCHRIJVING:
YeastpRofile is een draagbare Windows-formuliertoepassing, geschreven in C#, om het profiel te berekenen van een genomische variabele rond transcriptiestart- (TSS) en beëindigingsplaatsen (TTS) van gist-mRNA's. Het profiel wordt verkregen door het berekenen van de genoombrede Pearson-correlatiecoëfficiënt (R) tussen de genomische variabelewaarden en de TSS- (of TTS)-tellingen bij incrementele verschuiving van de getranscribeerde streng. De gegevens van TSS- en TTS-tellingen die zijn gebruikt om de profielen te berekenen, zijn ontleend aan het werk van Pelechano et al. (1). Het invoerbestand moet een BedGraph-geformatteerd bestand zijn, gebaseerd op de gistgenoomsequentie-release R64. Het uitvoerbestand is een door tabs gescheiden teksttabel die R-waarden rapporteert voor de verschillende verschuivingen van variabele coördinaten ten opzichte van TSS of TTS. Er wordt ook vermeld dat R gerelateerd is aan elke streng om te verifiëren dat een vergelijkbaar profiel wordt verkregen in de twee richtingen van transcriptie.1) V. Pelechano, W. Wei, LM Steinmetz, Uitgebreide transcriptionele heterogeniteit onthuld door isovormprofilering, Nature, 497 (2013) 127-13.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
C#
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.