Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie FastQC, której najnowszą wersję można pobrać jako v0.12.1sourcecode.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie FastQC z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Szybka kontrola jakości
OPIS
FastQC to narzędzie do analizy kontroli jakości zaprojektowane w celu wykrywania potencjalnych problemów w zestawach danych sekwencjonowania o dużej przepustowości. Jego celem jest zapewnienie prostego sposobu sprawdzania jakości surowych danych sekwencyjnych pochodzących z potoków sekwencjonowania o dużej przepustowości. Robi to, uruchamiając modułowy zestaw analiz na jednym lub kilku surowych plikach sekwencji w formacie fastq lub bam. Następnie tworzy raport podsumowujący wyniki i podkreślający wszelkie obszary, w których biblioteka może wydawać się nietypowa. Powinno to skierować Cię do miejsca, w którym Twoje dane mogą mieć problemy i umożliwić podjęcie niezbędnych kroków w celu ich poprawienia przed przystąpieniem do dalszej analizy.
FastQC nie jest powiązany z żadnym konkretnym typem techniki sekwencjonowania, więc może być używany do przeglądania bibliotek różnych typów eksperymentów (sekwencjonowanie genomowe, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq itp.).
Zakładka Charakterystyka
- Importuje dane z plików BAM, SAM lub FastQ
- Oferuje szybki przegląd, który podkreśla potencjalne obszary problematyczne
- Wykresy podsumowujące i tabele do szybkiej oceny danych
- Eksportuj wyniki do HTML
- Może być używany w trybie offline
Język programowania
Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
