Это приложение для Linux под названием CollagenFinder, последнюю версию которого можно загрузить как CollagenFinder.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CollagenFinder с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Поиск коллагена
Ad
ОПИСАНИЕ
CollagenFinder (CF) — это программный инструмент для поиска последовательностей CLP в заданной последовательности нуклеотидов. CF сканирует последовательность нуклеотидов во всех шести возможных рамках считывания. Дополнительные процедуры фильтрации обеспечивают более точное предсказание CLP:
- обнаружение остатка триптофана и стоп-кодонов и удаление соответствующих CLP,
- значение отсечки по номеру повтора GXY. Если нам нужен CLP длиной 36 и более, мы должны использовать значение отсечки, равное 4.
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Perl
Среда базы данных
Perl DBI / DBD
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/collagenfinder/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
