นี่คือคำสั่ง asn2idx ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
asn2idx - ดัชนี ASN.1 Bioseq-sets สำหรับการเข้าถึงแต่ละลำดับอย่างรวดเร็ว
เรื่องย่อ
asn2idx [-] [-b] [-d dir] [-f กรอง] -p เส้นทาง [-r เส้นทาง] [-t] [-x Str]
DESCRIPTION
asn2idx จัดทำดัชนี ASN.1 ชุด Bioseq (เช่นไฟล์เผยแพร่ GenBank) เพื่อเพิ่มความเร็วในการดึง
ลำดับแต่ละรายการที่มีอยู่ สำหรับแต่ละไฟล์ที่ประมวลผล จะให้ผลลัพธ์เป็น
ไฟล์เอาต์พุตในไดเร็กทอรีเดียวกันกับนามสกุล .idx.
OPTIONS
สรุปตัวเลือกอยู่ด้านล่าง
- พิมพ์ข้อความการใช้งาน
-b ชุด Bioseq เป็นไบนารี
-d dir ไดเรกทอรีย่อยที่จำเป็น
-f กรอง
ตัวกรอง (ค่าเริ่มต้น = gbcon,gbest,gbgss,gbhtg,gbsts)
-p เส้นทาง
เส้นทางไปยังไฟล์
-p เส้นทาง
เส้นทางสู่ผลลัพธ์
-t เรียกซ้ำ
-x Str สตริงย่อยการเลือกไฟล์ (ค่าเริ่มต้น = .aso)
ใช้ asn2idx ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net