Ito ang Linux app na pinangalanang High-Throughput Tabular Data Processor na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang HTDP.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang High-Throughput Tabular Data Processor para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
High-Throughput Tabular Data Processor na tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) ay Java application na nilayon upang mapadali ang data exploration at pagbabawas ng mga gawain sa malalaking text file na nagreresulta mula sa mga high throughput na teknolohiya, hal. massively parallel sequencing o microarrays. Ang software ay na-optimize para sa microarray at malalim na parallel sequencing data, gayunpaman maaari itong tumanggap ng anumang character delimited tabular data set. Ang HTDP ay maaari ding mag-import, magproseso at mag-convert ng Variant Call Format (VCF) file ver. 4.0, 4.1 at 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).Nagbibigay ang HTDP ng mabilis na pag-andar sa pag-filter at maaaring magproseso ng data na binubuo ng isa o maramihang mga input file.
Sipi: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – Platform na independiyenteng graphical na tool para sa pagproseso ng malalaking set ng data. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Mga tampok
- gumagana sa anumang data ng column na na-delimite ng character (hal. BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- pagsamahin ang mga file ng tabular na data nang patayo at pahalang
- pagsamahin ang anumang mga file sa tabular na data gamit ang lokasyon ng genome o (mga) karaniwang column
- walang limitasyong pag-filter at mga kakayahan sa pagbabawas ng data
- iba't ibang mga file patungkol sa format at nilalaman ay maaaring masuri nang sabay
Wika ng Programming
Java
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/htdp/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
