Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen cmtk-detect_adni_phantom komutudur.
Program:
ADI
Detect_adni_phantom - Hayali görüntüdeki ADNI hayalet yer işaretlerini algıla
SİNOPSİS
algılama_adni_fantom GirdiGörüntü ÇıktıXML
TANIM
Bu araç, Magphan'ın 3B görüntüsündeki tüm küresel yer işaretlerinin konumlarını algılar.
EMR051 yapısal görüntüleme fantomu (aka ADNI Phantom).
SEÇENEKLER
Küresel Toolkit Opsiyonlar (bunlar vardır Paylaşılan by herşey CMTK aletler)
--yardım et
Standart çıktıya temel komut satırı seçeneklerinin listesini yazın.
--Herkese yardım et
Standart çıktıya temel ve gelişmiş komut satırı seçeneklerinin tam listesini yazın.
--wiki
MediaWiki işaretlemesinde standart çıktıya komut satırı seçeneklerinin listesini yazın.
--adam
Standart çıktıya 'nroff' işaretlemesinde man sayfası kaynağını yazın.
--versiyon
Araç takımı sürümünü standart çıktıya yazın.
--Eko
Geçerli komut satırını standart çıktıya yazın.
--ayrıntılı düzey
Ayrıntı düzeyini ayarlayın.
--ayrıntılı, -v
Ayrıntı düzeyini 1 artırın (kullanımdan kaldırıldı; geriye dönük uyumluluk için desteklenir).
--İş Parçacığı
Maksimum paralel iş parçacığı sayısını ayarlayın (POSIX iş parçacıkları ve OpenMP için).
Phantom Bulma Opsiyonlar
--hoşgörülü
Kısmen kesilmiş işaret küreleri gibi sorunlara karşı hoşgörülü olun. Bu kullanılmalı
yalnızca gerektiğinde dikkatli olun ve hem hayali görüntü hem de algılama sonuçları
Algılama sorunlarının kaynağını belirlemek ve doğrulamak için dikkatlice incelenmelidir.
güvenilir sonuçlar.
--herhangi bir yönelim
Fantomun standart oryantasyonunu varsaymayın, yani taranan fantomlara izin verin
Tepe taklak. Bu, kusurlu fantomların tespitini daha az sağlam hale getirir.
--geri dönüş-cnr-centroid
için SNR küresinin merkezi yerine CNR kürelerinin ağırlık merkezini kullanmaya bir yedeği zorla.
ilk yönlendirme. Bu, örneğin SNR küresi kırıldığında kullanılabilir.
kapalıdır ancak otomatik geri dönüşü tetiklemeyecek şekilde konumlandırılmıştır.
--erode-snr
SNR tahminini hesaplamadan önce SNR küresini bu mesafe kadar aşın. [Varsayılan: 10]
--erode-cnr
CNR tahminini hesaplamadan önce her CNR küresini bu mesafe kadar aşındırın. [Varsayılan: 5]
--rafine-xform
Her yeni dönüm noktası eklendikten sonra tahmini afin dönüşümünü hassaslaştırın.
--rafine-outliers
İlk küreden sonra tahmini dönüşüme dayalı olarak aykırı değer noktalarını hassaslaştırın
algılama geçişi
--aykırı değerleri hariç tut
Son dönüşümleri sığdırmadan önce aykırı değer işaretlerini hariç tutun.
--no-bias-doğru-küreler
Algılanan her küre için yoğunluk önyargı alanı düzeltmesini devre dışı bırakın. Bu muhtemelen
SNR/CNR tahminlerinin doğruluğunu azaltır ve ayrıca daha küçük
küreler, ancak önyargı düzeltmenin tamamen başarısız olduğu aşırı durumlarda yardımcı olabilir.
Çıktı Opsiyonlar
--write-etiketler
Çıktı etiketi görüntü yolu. Bu görüntü, her biri algılanan kürelerin maskesini içerir.
CMTK'nın ADNI hayalet referans tablosundaki sıralarına göre benzersiz bir şekilde etiketlenmiştir. [Varsayılan:
YOK]
--yazma-sert
Fantom uzaydan RAS görüntüsüne sabitlenmiş katı dönüşüm için çıktı yolu
standart alan. Bu dönüşüm, her bir kürenin görüntüde nerede olması gerektiğini tanımlar.
[Varsayılan: YOK]
--yazma-afine
Fantom uzaydan RAS görüntüsüne takılan afin dönüşüm için çıktı yolu
standart alan. Bu, en yakın lineer uyum dönüşümüdür ve bu nedenle
monte edilmiş rijit dönüşümlerde bulunmayan ölçek ve kesme bileşenlerini içerir.
Bu bileşenler tarayıcının yanlış kalibrasyonundan ve bozulmasından kaynaklandığından, bu
dönüştürme görüntüdeki doğru küre konumlarını BELİRTMEZ, ancak
daha ziyade, ölçek yanlış kalibrasyonunun nicelleştirilmesine izin verir. [Varsayılan: YOK]
YAZARLAR
Torsten Rohlfing, Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff ve Yaroslav Halchenko
onworks.net hizmetlerini kullanarak cmtk-detect_adni_phantom'u çevrimiçi kullanın
