Це програма для Linux під назвою MAGECK, останню версію якої можна завантажити як broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MAGECK з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
MAGECK
ОПИС
Аналіз геномного нокауту CRISPR-Cas9 (MAGeCK) на основі моделі — це обчислювальний інструмент для ідентифікації важливих генів за допомогою нещодавньої технології CRISPR-Cas9 нокауту в масштабі геному.
Щоб отримати інструкції та документацію, перейдіть на сторінку вікі.
MAGECK розроблено Вей Лі та Хан Сю з лабораторії доктора Сяоле Ширлі Лю в Інституті раку Дани-Фарбера/Гарвардській школі громадського здоров’я, а підтримується лабораторією Вей Лі в Дитячому національному медичному центрі. Ми дякуємо за підтримку Програми Клаудії Адамс Барр з інноваційних фундаментальних досліджень раку та NIH/NHGRI для розробки MAGECK.
Функції
- Найпопулярніший обчислювальний алгоритм скринінгового аналізу
- Понад 400 цитат і 60 тисяч завантажень
- Простий, легкий у використанні конвеєр для скринінгу генів у експериментах CRISPR-Cas9 Knockout на рівні всього геному
- Повна документація з підручниками, які легко розпочати
- Висока чутливість і низький рівень помилкового виявлення
- Активне підтримка вихідного коду з новими функціями та виправленнями помилок
- Підтримка від спільноти розробників і користувачів
- Набір функцій візуалізації, які генерують стандартні цифри публікації
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Python, C
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/mageck/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.