Đây là lệnh bp_hmmer_to_tablep có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
bp_hmmer_to_table - chuyển đầu ra HMMER sang định dạng bảng
SYNOPSIS
bp_hmmer_to_table [-e evaluefilter] [-b bitcorefilter] [--header] [-o outfile] inputfile1 inputfile2 ...
MÔ TẢ
Tùy chọn dòng lệnh:
-e / - evalue evalue - lọc theo evalue
-b / - bitcore bitcore - lọc theo bitcore
--header - cờ boolean để in tiêu đề cột
-o / - out - tệp đầu ra tùy chọn để ghi dữ liệu,
nếu không sẽ ghi vào STDOUT
-h / - trợ giúp - hiển thị tài liệu này
Về mặt kỹ thuật, không phải là tập lệnh SearchIO vì tập lệnh này không sử dụng bất kỳ thành phần Bioperl nào nhưng là một
hữu ích và nhanh chóng. Đầu ra là đầu ra dạng bảng.
chuỗi/miền truy vấn (chúng được lật ngược cho hmmsearch/hmmpfam)
bắt đầu truy vấn
kết thúc truy vấn
tên miền/chuỗi hoặc gia nhập PFAM
nhấn bắt đầu
kết thúc
Điểm số
giá trị điện tử
tên miền/tên chuỗi (đây là những tên được lật ngược cho hmmsearch / hmmpfam)
TÁC GIẢ - Jason Stajich
Jason Stajich jason_at_bioperl-dot-org
Sử dụng bp_hmmer_to_tablep trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
