Đây là lệnh gmx-view có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gmx-view - Xem quỹ đạo trên thiết bị đầu cuối X-Windows
SYNOPSIS
chế độ xem gmx [-f [<.xtc / .trr / ...>]] [-s [<.tpr>]] [-n [<.ndx>]] [-b ]
[-e ] [-dt ]
MÔ TẢ
GMX lượt xem là trình xem quỹ đạo GROMACS. Chương trình này đọc một tệp quỹ đạo, một lần chạy
tệp đầu vào và tệp chỉ mục và vẽ biểu đồ cấu trúc 3D của phân tử của bạn trên X tiêu chuẩn của bạn
Màn hình của giao diện Window. Không cần máy trạm đồ họa cao cấp, nó thậm chí hoạt động trên Monochrome
Màn hình.
Các tính năng sau đã được triển khai: Chế độ xem 3D, xoay, dịch và chia tỷ lệ
của (các) phân tử của bạn, nhãn trên nguyên tử, hoạt ảnh của quỹ đạo, bản cứng trong PostScript
định dạng, bộ lọc nguyên tử do người dùng xác định chạy trên MIT-X (X thực), mở cửa sổ và mô típ, người dùng
menu thân thiện, tùy chọn loại bỏ tính tuần hoàn, tùy chọn hiển thị hộp tính toán.
Một số tùy chọn dòng lệnh X phổ biến hơn có thể được sử dụng: -bg, -fg thay đổi màu sắc, -nét chữ
tên phông chữ thay đổi phông chữ.
LỰA CHỌN
Các tùy chọn để chỉ định các tệp đầu vào:
-f [<.xtc / .trr / ...>] (traj.xtc)
Quỹ đạo: xtc trr cpt Gro g96 pdb tng
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
Tệp đầu vào chạy xdr di động
-n [<.ndx>] (index.ndx) (Tùy chọn)
Tệp chỉ mục
Các lựa chọn khác:
-b (0)
Khung đầu tiên (ps) để đọc từ quỹ đạo
-e (0)
Khung cuối cùng (ps) để đọc từ quỹ đạo
-dt (0)
Chỉ sử dụng khung khi t MOD dt = lần đầu tiên (ps)
Được biết đến CÁC VẤN ĐỀ
· Tùy chọn bóng không hoạt động
· Một số lần đổ lõi mà không có lý do chính đáng
Sử dụng gmx-view trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
