pymvpa2-dump - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

pymvpa2-dump - xuất các thành phần tập dữ liệu sang các định dạng (tệp) khác

SYNOPSIS

pymvpa2 đổ [--phiên bản] [-h] -i BỘ DỮ LIỆU [BỘ DỮ LIỆU ...] [-s | --sa SA | --fa FA | --da DA]
[-o OUTPUT] [-f {hdf5, nifti, npy, txt}] [--mapper-bộ dữ liệu BỘ DỮ LIỆU [BỘ DỮ LIỆU ...]]
[--hdf5-nén LOẠI]

MÔ TẢ

Kết xuất các thành phần của tập dữ liệu ở các định dạng khác nhau

Một thành phần tập dữ liệu tùy ý duy nhất (dữ liệu mẫu, thuộc tính mẫu, thuộc tính tính năng,
thuộc tính tập dữ liệu) có thể được chọn và xuất sang định dạng khác. Một danh sách được hỗ trợ
các định dạng và khả năng tương ứng của chúng ở bên dưới.

ĐẦU RA VĂN BẢN PLAIN

Dữ liệu số 1D và 2D có thể được xuất dưới dạng văn bản thuần túy. Ngoài danh sách các chuỗi là
cũng được hỗ trợ. Thông thường, dữ liệu được xuất với một phần tử trên mỗi dòng, ngoại trừ 2D
ma trận số, trong đó toàn bộ hàng được viết trên một dòng (phân cách bằng dấu cách).

Đối với tất cả dữ liệu không được hỗ trợ, một cảnh báo sẽ được đưa ra và mô tả bằng văn bản được cắt ngắn về
thành phần tập dữ liệu được đưa ra.

LƯU TRỮ HDF5

Dữ liệu tùy ý (các loại) có thể được lưu trữ trong các thùng chứa HDF5. Đối với dữ liệu đơn giản
được hỗ trợ bởi HDF5, tập dữ liệu HDF5 cấp cao nhất được tạo và chứa tất cả dữ liệu. Phức tạp, không
các kiểu dữ liệu được hỗ trợ nguyên bản được tuần tự hóa trước khi được lưu trữ trong HDF5.

NUMPY'S NPY BINARY FILES

Định dạng dữ liệu này là để lưu trữ dữ liệu số (với số kích thước tùy ý trong
định dạng nhị phân).

TỆP NIFTI

Định dạng dữ liệu này dành cho hình ảnh không gian (đa chiều). Tập dữ liệu đầu vào phải có
ánh xạ có thể ánh xạ ngược thành phần tập dữ liệu tương ứng trở lại không gian hình ảnh.

LỰA CHỌN

--phiên bản
hiển thị thông tin về phiên bản và giấy phép của chương trình và thoát

-h, --Cứu giúp, --help-np
hiển thị thông báo trợ giúp này và thoát. --help-np vô hiệu hóa mạnh mẽ việc sử dụng máy nhắn tin
để hiển thị sự trợ giúp.

-i BỘ DỮ LIỆU [Bộ dữ liệu ...], --đầu vào BỘ DỮ LIỆU [DATASET ...]
(các) đường dẫn đến một hoặc nhiều tệp tập dữ liệu PyMVPA. Tất cả các tập dữ liệu sẽ được hợp nhất thành một
tập dữ liệu duy nhất (vstack'ed) theo thứ tự đặc điểm kỹ thuật. Trong một số trường hợp, tùy chọn này có thể
cần được chỉ định nhiều lần nếu nhiều bộ dữ liệu đầu vào, nhưng riêng biệt,
yêu cầu.

-o ĐẦU RA, - đầu ra OUTPUT
tên tệp xuất ra. Nếu không có tên tệp đầu ra nào được cung cấp, đầu ra sẽ được chuyển hướng đến stdout,
nếu được định dạng dữ liệu cho phép

-f {hdf5, nifti, npy, txt}, --định dạng {hdf5, nifti, npy, txt}
định dạng đầu ra

--mapper-bộ dữ liệu BỘ DỮ LIỆU [DATASET ...]
đường dẫn đến tập dữ liệu PyMVPA có bộ ánh xạ sẽ được sử dụng cho các tính năng ánh xạ ngược
vào không gian thể tích để xuất NIfTI. Theo mặc định, trình ánh xạ trong tập dữ liệu đầu vào
Được sử dụng.

Các lựa chọn cho lựa chọn tập dữ liệu các thành phần:
-s, --mẫu
kết xuất các mẫu tập dữ liệu.

--sa SA
tên của thuộc tính mẫu được kết xuất.

--fa FA
tên của thuộc tính tính năng được kết xuất.

--da DA
tên của thuộc tính tập dữ liệu được kết xuất.

Tùy chọn cho HDF5 đầu ra:
--hdf5-nén LOẠI
kiểu nén để lưu trữ HDF5. Các giá trị có sẵn phụ thuộc vào HDF5 cụ thể
cài đặt. Các giá trị điển hình là: 'gzip', 'lzf', 'szip' hoặc các số nguyên từ 1 đến 9
cho biết mức độ nén gzip.

VÍ DỤ

In thuộc tính mẫu

$ pymvpa2 kết xuất -i mydata.hdf5 --sa subj

Xuất mảng dữ liệu mẫu sang định dạng .npy của NumPy

$ pymvpa2 dump -i mydata.hdf5 -s -f npy -d mysamples.npy

Sử dụng pymvpa2-dump trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net