Đây là ứng dụng Linux có tên qure có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là QuRe_v0.99971.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên qure này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
quơ
MÔ TẢ
QuRe là một chương trình tái tạo lại các loài quasispecies vi rút, được phát triển đặc biệt để phân tích dữ liệu NGS đọc dài (> 100 bp). Phần mềm thực hiện việc sắp xếp các đoạn trình tự so với bộ gen tham chiếu, tìm ra sự phân chia tối ưu của bộ gen thành các cửa sổ trượt dựa trên phạm vi bao phủ và sự đa dạng và cố gắng tái tạo lại tất cả các trình tự riêng lẻ của các loài quasispecies - cùng với mức độ phổ biến của chúng - bằng cách sử dụng phương pháp phỏng đoán thuật toán phù hợp với các phân phối đa thức của các biến thể virus riêng biệt chồng chéo lên nhau qua bộ phận gen. QuRe đi kèm với phương pháp sửa lỗi Poisson tích hợp sẵn và phân cụm xác suất sau xây dựng lại, cả hai đều được tham số hóa dựa trên tỷ lệ lỗi nhất định trong các vùng homopolymeric và không homopolymeric.Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/qure/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
