这是 rdp_classifier 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
rdp_classifier - 来自下一代测序的分类分配
用法：
rdp_分类器 [-F ] [-G ] [-o ] [-q ] [-t ] [-w ]
商品描述
RDP 分类器是一种朴素贝叶斯分类器，可以快速准确地提供
从域到属的分类分配，每个分配的置信度估计。
-f， - 格式
所有制表符分隔的输出格式：[allrank|fixrank|db]。 默认为allrank。
allrank：输出应用于每个序列的所有等级的结果：seqname，
方向，分类群名称，等级，conf，... fixrank：只输出结果
固定排名顺序：域、门、类、顺序、科、属 db：输出
seqname、trainset_no、tax_id、conf。 这有利于存储在数据库中
-g， - 基因
16srrna|fungallsu，16S rRNA 或真菌 LSU 基因的默认训练模型。
此选项将被覆盖 --train_propfile 选项
-o， - 输出文件
分类分配的输出文件名
-q,--查询文件
查询文件包含以下格式之一的序列：Fasta、Genbank 和
欧洲分子生物学实验室
-t,--train_propfile
指定一个包含训练文件映射的属性文件（如果它位于）
在数据/分类器/之外。 注意：训练文件和属性文件应该
位于同一目录中。 默认属性文件设置为
数据/分类器/16srrna/rRNAClassifier.properties。
-w,--minWords
每个引导试验的最小单词数，默认为单词的 1/8。
最小值为 5
使用 onworks.net 服务在线使用 rdp_classifier
