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run_mappers - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 run_mappers

这是 run_mappers 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


run_mappers - 运行读取映射器以将读取映射到参考基因组

概要


运行映射器 名字 阅读 -i -o OUT -m 映射器

商品描述


运行读取映射器将读取映射到参考基因组。

NAMES 文件中的名称将插入到提供的字符串模式中。 每个图案
必须正好包含一个“%s”占位符(python 字符串格式)。

配置


名字 名称文件的文件名; 纯文本名称文件每个应包含一个名称
线。 该名称在整个算法中用作标识符。

阅读 包含要映射的读取的文件。

-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出

-m 映射器, --映射器=映射器
core/tools.py 中定义的映射器标识符 [默认:无]

-i 参考, - 指数=
模式,当与名称一起使用时指向参考序列/索引。
名称的占位符是“%s”。 [默认:./ref/%s.fasta]

-o 出去, - 输出=OUT
模式,当与名称一起使用时,指向输出 SAM 文件。 占位符
名字是“%s”。 [默认:./SAM/%s.sam]

使用 onworks.net 服务在线使用 run_mappers


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