这是 SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh - 预测氨基酸取代对
蛋白质功能
概要
SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh
[BLAST_PROCESSORS]
商品描述
SIFT 预测氨基酸取代是否影响蛋白质功能基于
序列同源性和氨基酸的物理性质。
结果存储在 ./ .SIFT预测.
该程序用于 FASTA 输入,是 SIFT 套件的一部分。
配置
fasta 格式的蛋白质序列。
要搜索的蛋白质数据库。 假定这些序列是功能性的。
要预测的替换文件。 见 /usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst
以格式为例。 如果你给'-',则整个的所有突变的分数
打印蛋白质序列。
[BLAST_PROCESSORS]
通过运行爆炸时要使用的处理器/内核数 -a 论据。
示例
SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh /usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta [BLAST_DB] /usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst
使用 onworks.net 服务在线使用 SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh