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SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh

这是 SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh - 预测氨基酸取代对
蛋白质功能

概要


SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh
[BLAST_PROCESSORS]

商品描述


SIFT 预测氨基酸取代是否影响蛋白质功能基于
序列同源性和氨基酸的物理性质。

结果存储在 ./ .SIFT预测.

该程序用于 FASTA 输入,是 SIFT 套件的一部分。

配置



fasta 格式的蛋白质序列。


要搜索的蛋白质数据库。 假定这些序列是功能性的。


要预测的替换文件。 见 /usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst
以格式为例。 如果你给'-',则整个的所有突变的分数
打印蛋白质序列。

[BLAST_PROCESSORS]
通过运行爆炸时要使用的处理器/内核数 -a 论据。

示例


SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh /usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta [BLAST_DB] /usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst

使用 onworks.net 服务在线使用 SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh


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