gmx-trjcat - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

gmx-trjcat - ملفات مسار متسلسلة

موجز

جي ام اكس ترجكات [-f [<.xtc / .trr / ...> [...]]] [-n [<.ndx>]] [-دموكس [<.xvg>]]
[-o [<.xtc / .trr / ...> [...]]] [انت ] [-xvg ]
[-b ] [-e ] [-dt ] [-[رواية]
[- [لا] تسوية] [-[بدون فرز] [- [لا] تابع]
[- [لا] الكتابة] [- [لا] قطة]

الوصف

GMX trjcat تسلسل العديد من ملفات مسار الإدخال بترتيب مرتبة. في حالة ضعف
الأطر الزمنية المستخدمة في الملف الأحدث. بتحديد -ضبط الوقت ستسأل
لوقت بدء كل ملف. يتم أخذ ملفات الإدخال من سطر الأوامر ، مثل
هذا أمر مثل GMX trjcat -f * .trr -o Fixed.trr يجب أن تفعل الحيلة. استخدام -قط، كنت
يمكن ببساطة لصق عدة ملفات معًا دون إزالة الإطارات ذات الوقت نفسه
طوابع بريدية.

يتم استنتاج أحد الخيارات المهمة عندما يكون ملف الإخراج من بين ملفات الإدخال. في هذا
في حالة إلحاق هذا الملف المعين مما يعني أنك لست بحاجة إلى تخزينه
ضعف كمية البيانات. من الواضح أن الملف المراد الإلحاق به يجب أن يكون هو الأقل
وقت البدء حيث يمكن للمرء فقط الإلحاق في نهاية الملف.

إذا كان -دموكس يتم إعطاء الخيار ، مسارات N المقروءة ، مكتوبة في مكان آخر
الطلب على النحو المحدد في .xvg ملف. ال .xvg يجب أن يحتوي الملف على شيء مثل:

0 0 1 2 3 4 5
2 1 0 2 3 5 4

الرقم الأول هو الوقت ، وتشير الأرقام اللاحقة إلى مؤشرات المسار. ال
الإطارات المقابلة للأرقام الموجودة في السطر الأول يتم جمعها في
مسار الإخراج. إذا كان عدد الإطارات في المسار لا يتطابق مع ذلك في ملف
.xvg الملف ثم يحاول البرنامج أن يكون ذكيا. احذر.

OPTIONS

خيارات لتحديد ملفات الإدخال:

-f [<.xtc / .trr / ...> [...]] (traj.xtc)
مسار: نشوة مفاعل طهران البحثي لجنة مناهضة التعذيب غرو g96 فوسفات الحكومة الوطنية الانتقالية

-n [<.ndx>] (index.ndx) (اختياري)
ملف الفهرس

-دموكس [<.xvg>] (remd.xvg) (اختياري)
xvgr / xmgr

خيارات لتحديد ملفات الإخراج:

-o [<.xtc / .trr / ...> [...]] (trajout.xtc)
مسار: نشوة مفاعل طهران البحثي غرو g96 فوسفات الحكومة الوطنية الانتقالية

خيارات أخرى:

انت (ملاحظة)
وحدة قيم الوقت: fs ، ps ، ns ، us ، ms ، s

-xvg
تنسيق قطعة xvg: xmgrace ، xmgr ، لا شيء

-b (-1)
أول مرة يتم فيها استخدام (ps)

-e (-1)
آخر وقت لاستخدام (ps)

-dt (0)
اكتب فقط الإطار عندما يكون t MOD dt = المرة الأولى (ps)

-[رواية (نعم)
اقرأ واكتب السرعات إن أمكن

- [لا] تسوية (لا)
تغيير وقت البدء بشكل تفاعلي

-[بدون فرز (نعم)
فرز ملفات المسار (وليس الإطارات)

- [لا] تابع (لا)
حافظ على الإطارات المتداخلة في نهاية المسار

- [لا] الكتابة (لا)
الكتابة فوق الإطارات المتداخلة أثناء الإلحاق

- [لا] قطة (لا)
لا تتجاهل الأطر الزمنية المزدوجة

استخدم gmx-trjcat عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net