cmtk-mcwarp: en línea en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mcwarp: registro no rígido multicanal

SINOPSIS

mcwarp [opciones] mcaffineOutput

DESCRIPCIÓN

Registro de imagen B-spline no rígido multicanal utilizando covarianza o histograma
medidas de entropía conjuntas basadas

OPCIONES

Global Herramientas De Seguros (estas están compartido by all CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.

--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.

--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.

--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.

--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.

--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.

- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.

--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).

--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).

Main De Seguros
--fuera-archivo , -o
Ruta del archivo de salida. [Defecto: NINGUNO]

--downnsample-from , -d
Factor de reducción de muestreo inicial [1]. [Defecto: 1]

--downnsample-to , -D
Factor de reducción de resolución final [1]. [Defecto: 1]

--promedio de muestra inferior
Reducir la resolución mediante el promedio de ventana deslizante [predeterminado: desactivado]) [Defecto: 0]

--liso
Sigma del kernel de suavizado gaussiano en múltiplos del tamaño de píxel de la imagen de la plantilla
[predeterminado: desactivado]) [Defecto: 0]

--espaciado de la cuadrícula
Separación de la cuadrícula del punto de control inicial en mm. [Defecto: 40]

- cuadrícula-espaciado-exacto
Espaciado de cuadrícula inicial exacto, incluso si no coincide con el campo de visión de la imagen. [Defecto: discapacitado]

--refinar-cuadrícula
Número de refinamientos de la cuadrícula de puntos de control. [Defecto: 0]

--retraso-refinar-cuadrícula
Retrase el refinamiento de la cuadrícula de puntos de control hasta después del refinamiento de píxeles.

- factor-umbral-arreglo-adaptativo
Factor de umbral de intensidad [0..1] para la fijación de parámetros adaptativos. [predeterminado: 0 - no
fijación] [Defecto: 0]

--adaptive-fix-thresh-factor-entropía
Factor de umbral de entropía [0..1] para la fijación de parámetros adaptativos. [predeterminado: 0 - no
fijación] [Defecto: discapacitado]

--arreglar-warp-x
Corrija la transformación (no deformar) en la dirección x.

--arreglar-warp-y
Corrija la transformación (no se deforme) en la dirección y.

--arreglar-warp-z
Corrija la transformación (no deformar) en la dirección z.

--jacobian-restriction-weight
Peso para la restricción de preservación de volumen jacobiano [Defecto: 0]

- histogramas, -H
Utilice histogramas multidimensionales para calcular entropías [predeterminado. [Esta is los
defecto]

--covarianza, -C
Utilice determinantes de la matriz de covarianza para calcular entropías.

--cúbico, -c
Usar interpolación cúbica [predeterminado: lineal]

--mi Usar métrica estándar de información mutua [predeterminada] [Esta is los defecto]

--nmi
Usar métrica de información mutua normalizada

- corrección de intensidad, -I
Corrija las intensidades de imagen usando la transformación local jacobiana para preservar el total
señal

- tamaño de paso inicial
Tamaño de paso del optimizador inicial en píxeles. [Defecto: 1]

- tamaño de paso final
Tamaño de paso del optimizador inicial en píxeles. [Defecto: 0.125]

--delta-f-umbral
Umbral opcional para terminar la optimización (nivel) si el cambio relativo del objetivo
la función cae por debajo de este valor. [Defecto: 0]

AUTORES

Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko

Use cmtk-mcwarp en línea usando los servicios de onworks.net