Este es el comando fprotdiste que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fprotdist: algoritmo de distancia de proteínas
SINOPSIS
fprotdista -secuencia seqsetall [-categorías entero] -Velocidad matriz -categorías propiedades
[-pesos propiedades] -método lista -gama lista -gamacoeficiente flotar
-invarcoeficiente flotar -aacateg lista -código lista -facilidad flotar -tratio flotar
-frecuencia base matriz -archivo de salida archivar [-imprimirdatos booleano] [-Progreso booleano]
fprotdista -ayuda
DESCRIPCIÓN
fprotdista es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del (los) grupo (s) de comando "Filogenia: Secuencia molecular".
OPCIONES
Entrada .
-secuencia seqsetall
Archivo que contiene una o más alineaciones de secuencia
-categorías entero
Valor predeterminado: 1
-Velocidad matriz
-categorías propiedades
-pesos propiedades
Adicionales .
-método lista
Valor predeterminado: j
-gama lista
Valor predeterminado: c
-gamacoeficiente flotar
Valor predeterminado: 1
-invarcoeficiente flotar
Valor predeterminado: 1
-aacateg lista
Valor predeterminado: G
-código lista
Valor predeterminado: u
-facilidad flotar
Valor predeterminado: 0.457
-tratio flotar
Valor predeterminado: 2.0
-frecuencia base matriz
Valor predeterminado: 0.25 0.25 0.25 0.25
Salida .
-archivo de salida archivar
-imprimirdatos booleano
Valor predeterminado: N
-Progreso booleano
Valor predeterminado: Y
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