gt-encseq-encode: en línea en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

gt-encseq-encode: codifica archivos de secuencia (FASTA / FASTQ, GenBank, EMBL) de manera eficiente.

SINOPSIS

gt encseq codificar archivo_secuencia [archivo_secuencia [archivo_secuencia ...]]

DESCRIPCIÓN

-mostrarestadísticas [si | no]
mostrar resultados de compresión (predeterminado: no)

-ssp [si | no]
posiciones del separador de secuencia de salida al archivo (predeterminado: sí)

-desde [si | no]
enviar descripciones de secuencia al archivo (predeterminado: sí)

-sds [si | no]
Descripción de la secuencia de salida posiciones del separador al archivo (predeterminado: sí)

-md5 [si | no]
generar sumas MD5 en el archivo (predeterminado: sí)

-clipdesc [si | no]
descripciones de clips después del primer espacio en blanco (predeterminado: no)

-se sentó [cadena]
especificar el tipo de representación de secuencia mediante una de las palabras clave direct, bytecompress,
eqlen, bit, uchar, ushort, uint32 (predeterminado: indefinido)

-adn [si | no]
la entrada es la secuencia de ADN (predeterminado: no)

-proteína [si | no]
la entrada es la secuencia de proteínas (por defecto: no)

-llanura [si | no]
procesar como texto sin formato (predeterminado: no)

-nombreíndice [cadena]
especificar el nombre del índice que se generará (predeterminado: indefinido)

-mapa [cadena]
especificar el archivo que contiene un mapeo de símbolos (predeterminado: indefinido)

-sin pérdida [si | no]
permitir la recuperación de la secuencia original sin pérdidas (predeterminado: no)

-v [si | no]
ser detallado (predeterminado: no)

-ayuda
mostrar ayuda para opciones básicas y salir

-ayuda +
mostrar ayuda para todas las opciones y salir

-versión
mostrar información de la versión y salir

PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO

Informar errores a[email protected]>.

Use gt-encseq-encode en línea usando los servicios de onworks.net