Esta es la aplicación de Linux llamada GNomEx cuya última versión se puede descargar como gnomex_tomcat_5.35.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada GNomEx con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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GNomEx
DESCRIPCIÓN
Nuestro código fuente ahora está en GitHub: https://github.com/hci-gnomex/gnomex. Consulte GitHub para obtener el código más reciente.
GNomEx es LIMS genómico y repositorio de datos. Contiene experimentos anotados y análisis posteriores, y proporciona pistas de datos a navegadores de genoma populares como IGB, IGV y navegador de genoma UCSC. El LIMS maneja todos los aspectos del experimento desde el pedido hasta la entrega de resultados. Las plataformas de experimentación compatibles incluyen Illumina HiSeq, MiSeq, iScan, secuenciación ABI Sanger, microarrays Affy y Agilent, Sequenom MassArray y Bioanalyzer.
GNomEx es una aplicación web con una interfaz de usuario de cliente Flash y un backend de Java que se ejecuta en Apache Tomcat. MySQL se utiliza para la base de datos, aunque se puede utilizar cualquier RDBMS moderno.
Caracteristicas
- Configurable para muchas plataformas diferentes de secuenciación y experimentos
- Soporte para múltiples instalaciones centrales
- Facturación automatizada / notificaciones al cliente
- Anotaciones configurables para experimentos, muestras o análisis
- Visor de archivos ABI integrado
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Basado en la Web
Lenguaje de programación
Java, Flexión
Entorno de base de datos
MySQL
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/gnomex/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
