pymvpa2-prep-fmri - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

pymvpa2-prep-fmri - עיבוד מקדים של נתוני fMRI עבור PyMVPA

תַקצִיר

pymvpa2-prep-fmri [אפשרויות]

תיאור

כלי זעיר להכנת ספרייה לניתוח טיפוסי של נתוני fMRI עם PyMVPA. כלים
מחבילת FSL ישמשו לעיבוד מקדים. זה לוקח סדרת זמן 4D fMRI כקלט
ומבצע את השלבים הבאים:

- לחלץ נפח לדוגמה

- בצע תיקון תנועה באמצעות עוצמת הקול לדוגמה כהתייחסות

- הפשטת גולגולת שמרנית ויצירת מסכות מוח

- מיסוך של סדרת הזמן מתוקנת התנועה עם מסכת המוח

כל התוצאות יאוחסנו בספרייה הנוכחית או בספריית משנה עם ה-
מזהה נושא (אם צוין).

אפשרויות

--גִרְסָה
הצג את מספר הגרסה של התוכנית וצא

-v מִלוּלִי, --מִלוּלִי=מִלוּלִי, --מֶלֶל=מִלוּלִי
רמת המלל של הפלט [ברירת מחדל: 0]

-h, - עזרה, --הַצִילוּ
הצג את הודעת העזרה הזו וצא

-s SUBJ, --מזהה נושא=SUBJ
מזהה נושא משמש כנתיב פלט

-e EXFUNC, --example-func-vol=EXFUNC
אמצעי אחסון (מזהה מספרי או 'אחרון', 'ראשון', 'אמצע') שישמש כדוגמה
תמונה פונקציונלית. ברירת מחדל: 10

-m MCFLIRT_OPTS, --mcflirt-options=MCFLIRT_OPTS
אפשרויות עבור MCFLIRT. '-plots' מתווסף אוטומטית

-p, --mcflirt-plots
צור קובץ PDF עם עלילות של פרמטרי תנועה

-b BET_OPTS, --אפשרויות הימור=BET_OPTS
אפשרויות עבור BET. '-m' מתווסף אוטומטית. ברירת מחדל: '-f 0.3' לניחוש בטוח של
מתאר המוח

השתמש ב-pymvpa2-prep-fmri באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net